要使新建的廠房符合GMP要求，廠房建筑過程中的質量控制甚為重要。凈化工程控制產品 (如硅芯片等) 所接觸大氣的潔凈度及溫濕度，使產品能在一個良好的環境空間中生產、制造。此環境空間的設計施工過程即可稱為凈化工程。土建中廠房結構要求由土木建筑技術人員去管理和控制，筆者在這里將介紹和車間GMP要求有關的問題。

墻面要求平整光滑，不留塵土易于清洗，所以墻面一般用高品質的防水涂料進行涂刷。潔凈級別高的廠房墻面可貼彩鋼板材料，內墻面之間和天花板的交界處應做成園角。

隔斷材料，一般采用鋁（Al)合金(熔點660℃)材料和聚苯乙烯彩鋼板材料。凈化標準對于大部分潔凈空間，為了防止外界污染侵入，需要保持內部的壓力（靜壓）高于外部的壓力（靜壓）。壓力差的維持依靠新風量，這個新風量要能補償在這一壓力差下從縫隙漏泄掉的風量。所以壓力差的物理意義就是漏泄（或滲透）風量通過潔凈室的各種縫隙時的阻力。

潔凈規范用風速可以正確地表示出單向流，因為風速越高室內就越潔凈。而每小時換氣次數與房間的體積有關，如吊頂的高低，因此不適合用來表示單向流。單向流室內的送風量是紊流室的很多倍（10到100倍）。特別是有潔凈級別的廠房均采用彩鋼板材料。這種材料的優點是重量輕，光亮平整，易清洗，施工簡便，易于生產工藝變更時工房改造。

對地面材料要求強度高，應耐磨損(零部件失效的一種基本類型)，光滑平整，易清洗，一般采用環氧樹脂地面。潔凈級別高的廠房地面不設地漏。

窗戶一般采用鋼窗和鋁（Al)合金窗戶，窗戶和墻面交接處應做成斜角，潔凈級別高的窗子應做成固定窗，窗玻璃和墻面應做成同一平面，防止窗沿積塵，且易于清洗。